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巴西橡胶树简单重复序列的鉴定及分离

文献类型： 中文期刊

作者： C.Bindu Roy 1 ; 田郎 2 ;

作者机构： 1.印度橡胶研究所基因组分析实验室

2.中国热带农业科学院橡胶研究所

关键词： 巴西橡胶树;简单重复序列;鉴定

期刊名称： 世界热带农业信息

ISSN： 1009-1726

年卷期： 2011 年 03 期

页码： 1-5

摘要： 本研究利用巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)这一重要产胶植物的基因组文库进行了简单重复序列(SSRs),也即微卫星序列的分离鉴定。对来自无性系GT1的小插入基因组文库进行SSRs(AC/TG及CT/GA基序)筛选鉴定共获得154个克隆。采用载体通用引物及重复序列进行PCR扩增发现,其中114个为阳性克隆。限制性酶切分析结果显示,这些阳性克隆中有6个为重复拷贝,故予以剔除。之后,对剩余108个克隆中的50个进行了序列分析。此外,试验中对来自优良无性系RRII105的大插入基因组文库也进行了筛选。所获24个阳性克隆的测序结果也证实了橡胶基因组中微卫星序列的存在。经过最终的序列分析,本研究共鉴定出67个具有不同特点的简单及复合型微卫星序列,其中59个来自GT1,其余8个来自RRII105。所检测到的重复基序包括二核苷酸(TG/AC,AG/TC,TA/AT),三核苷酸(AAG,AGG,ATT),四核苷酸(GAAA,AAGG,ATCC,TAAA,AAAT),以及一个五核苷酸(GAAAT)。与其它作物的报道结果类似,在橡胶基因组中也观察到大量的CT/GA重复。

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