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番木瓜酸性转化酶基因家族预测及生物信息学初步分析

文献类型: 中文期刊

作者: 严丹凤 1 ; 吴晓慧 2 ; 耿梦婷 2 ; 范洁 2 ; 姚远 2 ; 李瑞梅 2 ; 郭建春 2 ;

作者机构: 1.海南大学农学院

2.海南大学农学院;中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词: 番木瓜;酸性转化酶;生物信息学分析

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2014 年 33 卷 02 期

页码: 374-381

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 酸性转化酶参与了番木瓜果实中蔗糖的韧皮部卸载,调控果实中糖类的积累。本文利用番木瓜基因组数据库信息,发现了番木瓜基因组中含有6个酸性转化酶基因,分别为细胞壁转化酶基因(CpCWINV1-3)和液泡转化酶基因(CpVINV1-3)。这些基因由3~7个外显子组成,其中CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2的N端均具有一个跨膜区域。蛋白质3D结构预测分析表明,CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2具有典型的N端β-螺旋桨模块(β-propeller module)和C端β-三明治模块(β-sandwich module),而CpCWINV3和CpVINV3的桨叶I上,均没有保守区NDPNG/A;CpCWINV2和CpVINV3均缺失了β-三明治模块。推测番木瓜细胞壁转化酶CpCWINV1、液泡转化酶CpVINV1和CpVINV2能正确履行催化蔗糖分解的功能。本研究有助于我们进一步揭示酸性转化酶在番木瓜果实发育及糖类积累过程中的作用。

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