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Race法扩增4株鸭肝炎病毒3′末端序列及其克隆分析

文献类型: 中文期刊

作者: 邵泽香 1 ; 韦强 2 ; 崔言顺 1 ; 鲍国连 2 ; 刘燕 2 ; 季权安 2 ;

作者机构: 1.山东农业大学

2.浙江省农业科学院

关键词: 3′RACE;鸭病毒性肝炎病毒;序列比对分析;3′端非编码区;Poly(A)

期刊名称: 浙江农业学报

ISSN: 1004-1524

年卷期: 2009 年 21 卷 03 期

页码: 225-229

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用3′RACE方法扩增并克隆了4株鸭肝炎病毒(DHV)(ZYM株、Z05株、Z07株和Z10株)的基因组的3′末端真实序列,包括部分非结构蛋白(3D)基因以及紧接着3D基因下游的3′端非编码区(untranslated region,UTR)和poly(A)尾巴。测序结果表明,扩增的特异性片段长度为597 nt(不包括polyA尾巴)。各毒株3′UTR均为315 nt,位于终止密码子TGA之后,比对分析结果表明各毒株间的同源性较高;4株DHV 3′末端核苷酸序列(不包括polyA尾巴)之间的同源性为96.3%~100%,而与参考毒株之间的同源性为93.5%~99.7%。在系统发生进化树上,各毒株亲缘关系较近。

  • 相关文献

[1]兔病毒性出血症病毒基因组3′端非编码区的分子克隆及生物信息学分析. 刘光清,张玉颖,云涛,倪征,张淼涛,梁华丽,华炯刚,李双茂,杜青云,盛祖恬. 2006

[2]Ⅰ型鸭病毒性肝炎RT-PCR检测方法研究. 华炯钢,王非,刘光清,倪征,云涛,余斌,梁华丽,李双茂. 2007

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