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基于宏基因组技术的橡胶树根际细菌多样性及驱动因素

文献类型： 中文期刊

作者： 庞通 1 ; 李玉武 1 ; 兰国玉 2 ; 魏亚情 2 ; 许心诺 2 ;

作者机构： 1.青岛农业大学园林与林学院

2.中国热带农业科学院橡胶研究所

关键词： 橡胶林;细菌;群落组成;多样性;驱动因子

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 604-611

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】分析橡胶树根际微生物群落多样性和组成差异及环境驱动因素，为优化橡胶林种植管理模式提供科学依据。【方法】利用宏基因组测序技术，从不同生态位视角分析橡胶树根际细菌群落结构和多样性及环境因素。【结果】在物种组成方面，共检测到细菌150个门，240个纲，414个目，809个科，3284个属和26 710个种，橡胶树根际细菌主要富集的优势菌门是变形菌门（Proteobacteria, 39.05%）、放线菌门（Actinobacteria, 29.91%）和酸杆菌门（Acidobacteria, 16.18%）,用主坐标分析法可视化呈现群落分布情况，发现根际与土壤样本聚集，根表细菌与土壤和根际细菌的分布具有显著差异，置换多元方差分析（PERMANOVA）也验证了该点；在多样性方面，橡胶树根际不同部位细菌群落多样性表现为土壤＞根际＞根表，α多样性Shannon指数在土壤和根表中差异较显著（P＜0.01）,其中根际和根表差异极显著（P＜0.001）,但土壤与根际之间没有显著差异（P＞0.05）,根表细菌α多样性与另外两个生态位隔室具有显著差异；在驱动因素方面，通过线性回归分析可知，细菌α多样性与pH、速效钾（AK）呈显著负相关（pH:R~2=0.53,P＜0.001;AK:R~2=0.20,P=0.005）,与温度（Temperature）、降水（Precipitation）、硝态氮（NN）呈正相关，所有环境因子中pH是影响细菌α多样性最重要的环境因子。RDA分析发现，pH和季节对细菌群落β多样性的影响最大，是影响细菌β多样性的最主要环境因子，季节、pH、全钾、全磷、土壤有机质、铵态氮、硝态氮、有效钾与橡胶林土壤细菌群落具有显著相关性（P＜0.05）。【结论】橡胶树根际细菌群落多样性和组成存在显著的生态位差异，pH和季节是影响微生物群落多样性最重要的环境因子。

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