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小麦TaSnRK2.9蛋白激酶基因克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 连魏卫 1 ; 唐益苗 2 ; 高世庆 2 ; 张朝 2 ; 赵昌平 2 ;

作者机构: 1.首都师范大学生命科学学院

2.北京杂交小麦工程技术研究中心

关键词: 小麦;TaSnRK2.9;cDNA;RT-PCR;系统进化分析;表达谱

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2011 年 27 卷 33 期

页码: 6-12

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了揭示小麦TaSnRK2.9基因的结构特点和功能特性,为该基因的研究和应用提供基础,根据已报道的水稻蛋白激酶SAPK9基因(GenBank登录号AB125310.1)序列信息,利用RT-PCR技术克隆了小麦TaSnRK2.9基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明:小麦TaSnRK2.9阅读框为1092bp,编码363个氨基酸,与水稻SAPK9亲缘关系最近,属于第三亚家族;亚细胞定位预测TaSnRK2.9定位在细胞质中;基因表达谱分析发现TaSnRK2.9在根、茎、叶、花等器官和组织中都有表达,并且在叶中的表达量最高。TaSnRK2.9的克隆为研究其在小麦中的功能提供基本信息和指导。

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