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荔枝果皮2个POD同源基因的生物信息学分析及酶活测定

文献类型： 中文期刊

作者： 郑雯 1 ; 张永丽 1 ; 王家保 2 ; 金志强 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院生物技术研究所

2.中国热带农业科学院环境资源保护研究所

关键词： 荔枝果皮;过氧化物酶;序列分析;褐变指数;POD活性

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2011 年 32 卷 03 期

页码： 68-73

收录情况： CSCD

摘要： 根据荔枝果皮cDNA文库,克隆到荔枝果皮的2个过氧化物酶基因,分别命名为LiPOD1和LiPOD2。经生物信息学分析表明,LiPOD1的ORF全长为1 062 bp,编码353个氨基酸;LiPOD2的ORF全长为990 bp,编码329个氨基酸。Blast分析表明,LiPOD1所推导的氨基酸序列与橡胶、毛果杨、甘薯具有较高的一致性,分别为87%、84%、81%;LiPOD2所推导的氨基酸序列与棉花、胡麻、紫花苜蓿、拟南芥具有较高的一致性,分别为88%、87%、85%、81%。保守结构域的分析表明,LiPOD1、LiPOD2基因均含有过氧化物酶完整的保守结构域,包括血红结合位点、活性位点、底物结合位点、钙离子结合位点。荔枝果皮褐变指数与过氧化物酶活性在常温贮藏过程中均呈增加的趋势。该研究结果对进一步验证这2个基因在荔枝果皮褐变衰老过程中的功能具有重要的理论意义。

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