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甘蔗液泡ATP酶C亚基基因克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 许志宇 1 ; 王俊刚 1 ; 杨本鹏 1 ; 张树珍 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 甘蔗;糖分积累;V-ATPase;RACE;序列分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2010 年 0 卷 09 期

页码： 82-86

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据筛选文库时获得的EST序列信息,利用RACE技术分离了一个甘蔗ATP酶C亚基基因,命名为ShVHA-C。该基因cDNA全长1 312 bp,含有1 056 bp的完整阅读框架,编码351个氨基酸。序列比对及结构预测分析表明,ShVHA-C编码的氨基酸序列与水稻、小麦、苜蓿、绿豆和蓖麻中相应基因氨基酸序列的一致性分别达到94.10%、93.22%、91.15%、91.15%和91.74%,与水稻一致性最高。在整个二级结构中,含有233个α-螺旋(alpha helix),占66.38%;含有5个延伸链(extended strand),占1.42%;含有113个无规则卷曲(random coil),占32.19%。此蛋白不具有导肽。整个多肽链表现为亲水性,没有明显的疏水区域,初步认为甘蔗ShVHA-C编码蛋白是亲水性蛋白。

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