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水稻黄矮病毒基因2的核苷酸序列

文献类型: 中文期刊

作者: 祝海涛 1 ; 陈晓英 2 ; 罗宗礼 2 ; 方荣祥 2 ; 高东明 2 ;

作者机构: 1.中国科学院微生物研究所植物生物技术开放实验室

2.中国科学院微生物研究所植物生物技术开放实验室,浙江省农业科学院病毒室

关键词: 水稻黄矮病毒,基因2,核苷酸序列,NS蛋白

期刊名称: 病毒学报

ISSN: 1000-8721

年卷期: 1997 年 04 期

页码:

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从水稻黄矮病毒(RYSV)基因组的cDNA文库中,获得了包含邻接核衣壳蛋白基因的基因2的克隆,并测定了其核苷酸序列。RYSV基因2的5′端起始序列推测为5′-AACAC-3′,该起始序列与RYSV其他基因及其他弹状病毒基因的5′端起始序列高度同源。通过测定感病水稻体内RYSV基因2的转录物的3′端序列,精确地定位了RYSV基因2的3′端终止位点。由此确定RYSV基因2全长1211个核苷酸,它含有42个核苷酸的5′端非翻译区,969个核苷酸的蛋白质编码区(包括一个终止密码子)及200个核苷酸的3′端非翻译区。RYSV基因2编码的蛋白质的氨基酸序列与其它弹状病毒基因2编码的磷酸化蛋白(VSV的P蛋白,RV的M1蛋白和SYNV的M2蛋白)相比,缺乏广泛的同源性,但尚存在一个长约30个氨基酸的序列保守区域。而且RYSV基因2编码的蛋白中含有7个可被CaseinkinaseⅡ磷酸化的位点(S/T-X-X-D/E),有可能它也是一个磷酸化蛋白。因此推测RYSV基因2编码RYSVNS蛋白。

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