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桃CHX基因家族响应激素及非生物胁迫分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郝兰兰 1 ; 张帆 2 ; 王鸿 1 ; 张雪冰 2 ; 陈建军 2 ;

作者机构： 1.甘肃农业大学园艺学院

2.甘肃省农业科学院林果花卉研究所

关键词： 桃;阳离子质子转运体;生物信息学;功能分析

期刊名称： 西北农业学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 011 期

页码： 2070-2081

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 阳离子质子转运体(cation/H+exchanger,CHX)基因家族在植物生长发育及逆境中发挥着重要功能.本研究对桃CHX基因家族进行鉴定,并分析其在非生物胁迫和激素中的表达模式.以拟南芥CHX成员为模型,在桃基因组数据库中进行BLASTP算法搜索初步比对出桃CHX家族成员,并利用在线工具Pfam和SMART进一步筛选.最终在桃中鉴定到26个CHX家族成员,分布在6条染色体上;系统进化分析将桃CHX家族基因划分为8个亚族,每个亚族的基因结构和Motif基本一致;共线性分析发现,种内中仅有1对线性关系;种间(桃与拟南芥)存在12对基因对.qRT-PCR表明,PpCHX基因家族成员在桃不同组织中的表达存在差异.此外,PpCHX02、PpCHX03、PpCHX05、PpCHX06、PpCHX13、PpCHX14、PpCHX15、PpCHX16、PpCHX18、PpCHX20、PpCHX22、PpCHX25均显著受200 mmol·L-1 NaCl、干旱(15%PEG)与低温(4℃)的诱导;PpCHX02、PpCHX03、PpCHX06、PpCHX13在赤霉素、水杨酸与脱落酸处理下均表现出高的表达水平.

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