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木薯磷脂酰肌醇磷酸5-激酶PIP5K9基因的克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙冲 1 ; 姚远 2 ; 耿梦婷 3 ; 王运林 1 ; 尚璐 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所海南大学农学院上海浦灵生物科技有限公司

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

3.海南大学农学院中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： 木薯;基因克隆;表达分析;磷脂酰肌醇磷酸5-激酶9

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 09 期

页码： 2290-2296

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 磷脂酰肌醇磷酸5-激酶9(PIP5K9)参与负调控植物碱性/中性转化酶的活性。本研究根据拟南芥PIP5K9基因序列信息,BLAST搜索木薯基因组数据库,找到木薯PIP5K9基因序列信息,利用RT-PCR方法克隆了木薯PIP5K9基因,命名为Me PIP5K9。生物信息学分析结果表明,该基因全长5 421 bp,包含8个外显子和7个内含子,CDS区全长2 496 bp,编码831个氨基酸。蛋白的N端包含8个MORN结构域,C端具有PIPKc结构域。序列比对和系统进化树分析结果表明,Me PIP5K9与麻风树PIP5K9亲缘关系最近,其次为蓖麻。基因表达分析发现,Me PIP5K9在叶片中表达量最高,其次是须根、茎和花,在块根和果中的表达量最低。本研究分离鉴定了木薯PIP5K9基因,分析了该基因的生物学信息及在不同组织中的表达模式,为进一步探讨其调控木薯碱性/中性转化酶的活性奠定基础。

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