文献类型： 中文期刊
作者： 张杰伟 1 ; 汤久杨 2 ; 陈兰芬 2 ; 王宁琳 2 ; 王宏芝 2 ; 魏建华 3 ;
作者机构： 1.北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心/农业基因资源与生物技术北京市重点实验室;北京农业职业学院;浙江商业职业技术学院
2.;北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心/农业基因资源与生物技术北京市重点实验室;北京农业职业学院;浙江商业职业技术学院
3.;北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心/农业基因资源与生物技术北京市重点实验室;北京农业职业学院;浙江商业职业技术学院;
关键词： 兰花;eIF5A;基因家族;进化分析
期刊名称： 福建农业学报
ISSN： 1008-0384
年卷期： 2017 年 11 期
页码： 1218-1223
收录情况： 北大核心
摘要： 为了系统分析兰花真核翻译起始因子5A(Eukaryotic translation initiation factor 5A,eIF5A)基因家族在兰花中如何发挥作用,利用兰花基因组数据库,通过生物信息学的方法,鉴定兰花eIF5A基因家族的基因结构、编码蛋白和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化分析。结果表明,兰花eIF5A基因家族含有eIF5A1和eIF5A2两个基因,分别含有5个和6个外显子。MEME保守基序分析显示,兰花eIF5A1和eIF5A2蛋白均含有1个保守的DNA结合寡核苷酸结合结构域(PF01287)。磷酸化位点预测分析表明兰花eIF5A1和eIF5A2蛋白均含有大量的潜在磷酸化位点。以上结果将为今后揭示兰花eIF5A1和eIF5A2蛋白的功能提供重要的线索。
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