文献类型: 中文期刊
作者: 贾静 1 ; 蒲金基 1 ; 张贺 1 ; 漆艳香 1 ; 谢艺贤 1 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
关键词: 芒果;胶孢炭疽菌;pH信号转导途径
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2014 年 35 卷 04 期
页码: 142-146
收录情况: CSCD
摘要: 通过本地查找胶孢炭疽病菌(Colletotrichum gloeosporioides)橡胶菌株全基因组测序数据,获得PalF基因的序列信息。利用同源克隆的方法扩增胶孢炭疽病菌芒果菌株PalF基因,获得片段大小为2 369 bp的目的基因片段。对该基因序列进行分析发现,该片段含有完整的开放式阅读框,与橡胶炭疽菌PalF基因的序列同源性达100%。用RT-PCR的方法获得PalF基因的cDNA序列,序列进行分析发现该基因全长为2 310 bp,其中含有1个大小为59 bp的内含子,推测编码769个氨基酸。对PalF基因的氨基酸序列进行推测保守结构域分析可知PalF蛋白中含有Arrestin-C保守结构域,推测该基因参与环境pH感应信号转导途径(Ambient pH-sensing signal transduetion pathway)的调控,为进一步研究该基因在环境pH感应信号转导途径中的作用奠定了基础。
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