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我国75份小麦品种SNP和SSR指纹图谱构建与比较分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘丽华 1 ; 刘阳娜 1 ; 张明明 1 ; 李宏博 1 ; 庞斌双 1 ; 赵昌平 1 ;

作者机构: 1.北京市农林科学院北京杂交小麦工程技术研究中心

关键词: SNP;SSR;小麦品种;指纹图谱

期刊名称: 中国农业科技导报

ISSN: 1008-0864

年卷期: 2020 年 005 期

页码: 15-23

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 联合利用Illumina 90K SNP芯片和毛细管高通量SSR检测技术,构建75份育成品种384个SNP和42个SSR位点的指纹图谱,比较两种标记在遗传多样性、遗传相似系数和鉴别能力等方面的特征.结果显示,SNP标记揭示的遗传多样性指数明显低于SSR标记,但能较好地反映品种间的遗传多样性;SNP标记揭示的遗传相似系数明显高于SSR标记,但两者呈极显著线性相关;384个SNP位点鉴定近等基因系的能力低于42个SSR位点,但去除近等基因系后,仅需8个SNP或4个SSR位点组合即可区分剩余的74份品种,表明最优位点组合具有较高的鉴定效率,在品种鉴定时可先采用少量标记进行初鉴,对于极近似品种可加大标记密度.首次结合SSR和SNP标记构建指纹图谱,证实了两者之间的一致性,提出了分子身份鉴定技术标记数量的选择思路,为小麦品种DNA身份鉴定技术标准制定提供了重要的参考依据.

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