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红毛丹SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 林兴娥 1 ; 牛俊海 1 ; 陈莹 1 ; 马蔚红 1 ; 臧小平 1 ; 葛宇 1 ; 王甲水 1 ; 周兆禧 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院海口实验站;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所;海南大学热带农林学院

关键词： 红毛丹;SSR;体系优化;引物筛选

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 21 期

页码： 7077-7081

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为建立适宜红毛丹SSR-PCR反应的最佳体系并筛选出具有多态性的SSR引物,采用L16(45)正交试验设计对反应体系中的各组分(模板DNA,引物, Mg~(2+), dNTPs和Taq DNA聚合酶)进行了优化,建立了红毛丹SSR-PCR的最佳反应体系(20μL):DNA模板30 ng、dNTPs 0.40 mmol/L、引物0.4μmol/L、Taq DNA聚合酶1.5 U、Mg~(2+)1.50 mmol/L;利用优化后的SSR-PCR体系和6份红毛丹种质基因组DNA模板,从50对SSR引物中筛选出11对条带清晰、多态性丰富、重复性好的SSR引物,多态比例达22%。本研究为后续红毛丹种质资源遗传多样性分析、分子指纹图谱构建和品种鉴定等研究提供了技术参考。

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[1]红毛丹SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选. 林兴娥,牛俊海,陈莹,马蔚红,臧小平,葛宇,王甲水,周兆禧. 2018

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