文献类型： 中文期刊

作者： 雷蕾 ¹ ; 马建 ² ; 吕红豪 ³ ; 颉建明 ¹ ; 郁继华 ¹ ; 康俊根 ² ;

作者机构： 1.甘肃农业大学

2.北京市农林科学院

3.中国农业科学院

关键词： 甘蓝;抗枯萎病;特异SNP;序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2016 年 31 卷 03 期

页码： 1-10

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在发掘甘蓝抗枯萎病基因FOC1中与抗性相关的特异性单核苷酸多态性(SNP),为进一步开发FOC1特异分子标记提供理论依据。在对11份甘蓝自交系材料枯萎病抗病表型鉴定基础上,通过基因测序,对每份材料中FOC1等位基因及相应的氨基酸序列变异进行分析。结果表明,FOC1等位基因序列之间共存在92处SNP变异和2处Indel变异,其中包含C381A/G等18个在抗、感材料中表现出特异性差异的SNPs。此18个特异的SNP中转换型比率为86.11%、颠换型比率为13.89%,4种碱基变异率以T/C、G/A最高,分别占47.22%和38.89%,而C/G和A/C变异率共占13.89%。本研究也发现抗、感材料中存在4个特异的SNP,可造成3个氨基酸的变化。