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蒙古羊Hoxd11基因CpG位点分布特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵静 1 ; 张立岭 2 ; 巴图 3 ;

作者机构: 1.内蒙古农业大学动物科学学院

2.海南大学动物科学系

3.内蒙古农牧科学院畜牧研究所

关键词: Hoxd11;CpG;蒙古羊;外显子;脊椎发育

期刊名称: 中国草食动物

ISSN: 1007-9726

年卷期: 2010 年 30 卷 05 期

页码: 11-13

摘要: 蒙古羊的Hoxd11基因全长1 772 bp。其中exon-1为778 bp,exon-2为236 bp,内含子为758 bp(Gen-Bank Accession No.GU059862)。Hoxd11 exon-1序列共有120个CpG,其中位于密码第1~2位的CpG共8个,全都编码精氨酸。位于密码第2~3位的CpG共47个,占所有CpG的39.17%(47/120),分别编码5个丝氨酸,18个脯氨酸,2个苏氨酸,22个丙氨酸。Hoxd11 exon-1的CpG数量明显高于第2外显子(12个)。Hoxd11exon-1序列中的高密度CpG,提示这个序列有可能是甲基化的高发区。这对于进一步分析这个基因对调控腰椎发育的作用,具有重要意义。

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