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光萼荷属植物SRAP-PCR反应体系建立与引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 张飞 1 ; 王炜勇 1 ; 张智 1 ; 葛亚英 1 ; 沈福泉 1 ; 郁永明 1 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院花卉研究开发中心

关键词: 光萼荷属;SRAP;正交试验设计;反应体系优化;引物筛选

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2012 年 28 卷 10 期

页码: 173-178

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了建立光萼荷属植物(Aechmea)SRAP-PCR反应体系,为今后光萼荷属植物种质资源研究提供技术支持,通过L16(45)正交试验设计,对光萼荷属植物SRAP反应体系中的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物和模板DNA浓度等5个因素进行优化试验,并筛选多态性SRAP引物组合。结果表明,光萼荷属植物的最佳SRAP反应体系为1.50 mmol/L Mg2+、400μmol/L dNTPs、1.5 U Taq DNA聚合酶、15μmol/L引物、30 ng模板DNA及1×PCR buffer。各因素对SRAP-PCR扩增反应结果影响的差异较大,依次为模板DNA>Taq DNA聚合酶>dNTPs>引物>Mg2+。从56对SRAP引物组合中筛选出51对扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物组合,多态性引物比率达90%以上。通过不同光萼荷属植物和不同引物组合对该反应体系进行验证,均获得了多态性丰富、条带清晰的扩增图谱,表明本研究建立的光萼荷属植物SRAP-PCR反应体系稳定可靠。

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