文献类型： 中文期刊
作者： 刘洋 1 ; 姚艳丽 2 ; 胡小文 2 ; 徐磊 2 ; 邢淑莲 2 ; 张树珍 2 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院湛江实验站
2.中国热带农业科学院湛江实验站,热带旱作农业研究中心;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,甘蔗研究中心
关键词： 割手密;过氧化氢酶;基因克隆;PCR验证
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2014 年 12 卷 06 期
页码： 1251-1258
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 割手密是栽培种甘蔗最重要的近缘物种之一,具有较强的抗逆性。本研究以高粱过氧化氢酶基因(NCBI登录号为XM002437586.1)c DNA序列为探针,对甘蔗EST数据库进行同源检索、筛选和拼接,后经基因组PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了2个割手密过氧化氢酶基因c DNA序列(Ss CAT-1c和Ss CAT-1d,Gene Bank登录号为KF864229和KF864230)。2条序列全长均为1 532 bp,包含10 bp的5'非翻译区(UTR)和43 bp的3'UTR,以及一个1 479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,此蛋白序列具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族。2条序列之间相似性为99.2%,存在12个单核苷酸多态性(SNP)位点,蛋白相似性99.0%,存在5个氨基酸变异位点。将推测的Ss CAT-1c和Ss CAT-1d蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种进行同源进化分析,均表现出极高的保守性。研究结果能对今后深入了解甘蔗及其近缘材料CAT基因家族的信息提供帮助,从而为进一步通过生物技术改良甘蔗品种抗逆性提供理论依据。
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