文献类型: 中文期刊
作者: 冯小艳 1 ; 王文治 1 ; 王俊刚 1 ; 沈林波 1 ; 赵婷婷 1 ; 冯翠莲 1 ; 张树珍 1 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所
关键词: 甘蔗;分子伴侣DnaJ;基因克隆;甘蔗线条花叶病毒(SCSMV);表达分析
期刊名称: 南方农业学报
ISSN:
年卷期: 2023 年 008 期
页码: 2310-2319
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】克隆甘蔗分子伴侣基因Sh DnaJ,并分析其在甘蔗线条花叶病毒(SCSMV)胁迫下的表达模式,为探究ShDnaJ基因在甘蔗应答SCSMV侵染过程中的功能和作用机制提供理论参考。【方法】通过同源克隆技术克隆ShDnaJ基因完整开放阅读框(ORF)序列,利用生物信息学软件对其进行分析,再利用绿色荧光蛋白(GFP)融合表达法分析ShDnaJ蛋白的亚细胞定位,采用实时荧光定量PCR检测ShDnaJ基因在甘蔗不同组织及在SCSMV胁迫下的表达水平。【结果】ShDnaJ基因ORF全长1260 bp,编码419个氨基酸残基,蛋白分子量为45682.47 Da,理论等电点(pI)为8.78,属于稳定的亲水蛋白,含有DnaJ结构域,属于DnaJ超家族成员,定位于内质网。ShDnaJ蛋白的二级结构由113个α-螺旋、31个β-转角、78个延伸链和197个无规则卷曲组成。ShDnaJ蛋白与高粱SbDnaJ蛋白的氨基酸序列相似性最高,为96.93%,说明两者亲缘关系最近。ShDnaJ基因在甘蔗根、茎和叶中均有表达,且根和茎中的相对表达量显著高于叶中(P<0.05,下同),但未成熟茎Sh DnaJ基因的相对表达量高于成熟茎;成熟叶ShDnaJ基因的相对表达量高于未成熟叶。随着处理时间的推移,SCSMV胁迫组和对照组(磷酸缓冲液处理)中ShDnaJ基因的相对表达量整体呈下降趋势,但SCSMV接种后不同时间点ShDnaJ基因的相对表达量均显著高于对照组。【结论】ShDnaJ基因具有组织表达特异性,且组织的成熟程度会影响其表达水平。SCSMV胁迫下该基因表达上调,推测该基因参与调控甘蔗植株对SCSMV的抗性。
- 相关文献
[1]木薯MeASR3基因的克隆及表达分析. 颜彦,铁韦韦,丁泽红,吴春来,胡伟. 2019
[2]木薯MeCIPK1基因克隆及表达分析. 颜彦,铁韦韦,丁泽红,吴春来,胡伟. 2018
[3]木薯MePYL8基因克隆及表达分析. 颜彦,铁韦韦,丁泽红,吴春来,胡伟. 2018
[4]番茄NAC转录因子SlNAC80的克隆及表达分析. 刘辉,王涛涛,张俊红,欧阳波,李汉霞. 2015
[5]巴西橡胶树HbRALF34的克隆及表达分析. 聂智毅,黎瑜,康桂娟,蔡海滨,曾日中. 2017
[6]香蕉中8个WRKY转录因子的克隆及表达分析. 贾彩红,王卓,张建斌,王静毅,苗红霞,刘菊华,金志强,徐碧玉. 2018
[7]巴西橡胶树HbγGCS基因克隆及表达分析. 邓治,刘向红,覃碧,李德军. 2012
[8]巴西橡胶树HbCYP450基因克隆与表达分析. 李晓娜,肖厚贞,万三连,张冬,张宇. 2017
[9]巴西橡胶树Hb GSK1的基因克隆与表达分析. 杨署光,吴绍华,陈月异,李言,张世鑫,史敏晶,田维敏. 2018
[10]香蕉抗坏血酸过氧化物酶基因的克隆及表达分析. 王卓,徐碧玉,贾彩红,李健平,刘菊华,张建斌,苗红霞,金志强. 2015
[11]巴西橡胶树一个AP2/EREBP转录因子的克隆及表达分析. 杜磊,张德春,邓治,刘向红,李德军. 2013
[12]火龙果HuICE1基因的克隆与表达分析. 陈翠,王卓,谢碧玉,任陪娣,徐碧玉,金志强,黄绵佳,从心黎. 2019
[13]香蕉MaMYBR1基因的克隆和表达分析. 杨会晓,王静毅,贾彩红,徐碧玉,金志强,李萌,陈翠,王卓. 2020
[14]巴西橡胶树HbNAM基因克隆和表达分析. 康桂娟,黎瑜,曾日中. 2016
[15]巴西橡胶树钙调蛋白基因的克隆和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,阳江华,秦云霞,唐朝荣. 2016
[16]木薯MeP5CS和MeP5CR基因克隆及其干旱胁迫下的表达分析. 付莉莉,韩冰莹,谭德冠,孙雪飘,张家明. 2016
[17]香蕉MabZIP53基因的克隆和表达分析. 王霞,林秋妹,贾彩红,王静毅,刘菊华,黄绵佳,从心黎,王卓. 2021
[18]橡胶树半胱氨酸蛋白酶基因(HbCP2和HbCP3)的克隆与表达分析. 梁启福,辛鲁生,龙翔宇,唐朝荣. 2014
[19]香草兰VpLFY基因的克隆与表达分析. 顾文亮,王辉,庄辉发,王华,朱自慧,宋应辉. 2016
[20]巴西橡胶树HbNAC33基因的克隆和表达分析. 康桂娟,黎瑜,曾日中. 2014
作者其他论文 更多>>
-
甘蔗磷酸丙糖/磷酸转运蛋白基因ShTPT的克隆与表达分析
作者:赵雪婷;赵婷婷;冯翠莲;高利燕;林继山;冯小艳;王文治;沈林波;张树珍;王俊刚
关键词:甘蔗;磷酸丙糖/磷酸转运蛋白(TPT);亚细胞定位;干旱胁迫;表达分析
-
甘蔗抗花叶病育种研究进展
作者:沈林波;潘继红;王会敏;冯小艳;张树珍;王文治
关键词:甘蔗;甘蔗花叶病;病害防治;抗花叶病育种
-
甘蔗AP2/ERF转录因子基因ShERF3的克隆、表达及其编码蛋白的定位
作者:赵雪婷;高利燕;王俊刚;沈庆庆;张树珍;李富生
关键词:甘蔗;ShERF3;非生物胁迫;表达分析;亚细胞定位
-
甘蔗ShPR10基因的克隆及其编码蛋白与甘蔗线条花叶病毒P1蛋白的互作研究
作者:黄佳艳;冯小艳;沈林波;王文治;胡海燕;张树珍
关键词:病程相关蛋白;PR10;甘蔗线条花叶病毒;RNA沉默抑制子;P1蛋白;甘蔗;蛋白互作
-
甘蔗叶片中蔗糖代谢酶活性及糖含量动态变化特征分析
作者:赵婷婷;杨本鹏;王俊刚;甘仪梅;张树珍
关键词:甘蔗;蔗糖代谢;蔗糖代谢酶;糖含量
-
海南省西番莲广东番木瓜曲叶病毒的检测鉴定
作者:顾珠琳;王健华;张树珍;王文治;徐永艳
关键词:西番莲;PaLCuGDV;检测鉴定
-
甘蔗单糖转运蛋白基因ShSTP7序列分析及组织表达特征测定
作者:赵婷婷;王俊刚;王文治;冯翠莲;冯小艳;张树珍
关键词:单糖转运蛋白;ShSTP7;糖吸收;表达分析;亚细胞定位;甘蔗