文献类型: 中文期刊
作者: 龙翔宇 1 ; 何斌 2 ; 曹冰 2 ; 梁启福 2 ; 方永军 1 ; 阳江华 1 ; 唐朝荣 1 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院橡胶研究所
2.海南大学农学院
关键词: 橡胶树;HbF2KP;基因克隆;基因表达;生物信息学
期刊名称: 南京林业大学学报(自然科学版)
ISSN: 1000-2006
年卷期: 2014 年 38 卷 04 期
页码: 23-28
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据拟南芥、蓖麻及杨树果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因(F2KP)的核苷酸序列,使用橡胶树胶乳转录组数据库拼接到1条1 228 bp的核苷酸序列,通过两次RACE-PCR获得了橡胶树长2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名为HbF2KP。ORF Finder软件分析结果显示,该序列含有211 bp的5'端非编码区,173 bp的3'端非编码区,以及长度为2 244 bp的开放阅读框(ORF)。氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的激酶和酯酶结构域,属于具有双功能的果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶。生物信息学分析显示,HbF2KP蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域且属于亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用。实时荧光定量PCR分析表明,HbF2KP基因在光合组织及非光合组织中均有表达。对非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式进行分析,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理及死皮胁迫调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与橡胶烃的生物合成调控及死皮胁迫应答。此外,HbF2KP表达受部分植物激素或激素类似物如乙烯利(ET)、植物生长素(2,4-D)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控,但调控作用不明显。
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