文献类型： 中文期刊

作者： 张朝红 ¹ ; 陈东玫 ¹ ; 杨凤秋 ¹ ; 赵同生 ¹ ; 李扬 ¹ ; 赵国栋 ¹ ; 赵永波 ¹ ;

作者机构： 1.河北省农林科学院昌黎果树研究所

关键词： 苹果;果锈;SLAF;遗传图谱;QTL分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2019 年 005 期

页码： 37-44

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了定位苹果果锈的QTL,鉴定果锈基因的遗传位点,以解析苹果果锈基因的分子遗传基础.以宫崎短枝富士*坂田津轻分离群体及其亲本为材料,基于SLAF-seq技术开发分子标签,并构建高密度遗传图谱,结合3个年份的田间表型数据,采用mapqtl进行果锈基因的QTL分析.结果表明,获得了522 122 315 reads(110.32 Gb)的测序数据,测序平均Q30为95.07%,平均GC含量为40.11%;开发了20 440个SLAF标签,7 309 729个SNP;构建了17个连锁群,4 075个上图标记,总图距为2 235.23 cM,平均图距达0.55 cM,上图标记的完整度为99.92%.共检测到了9个果锈相关的QTL,分别分布在Chr3、Chr9、Chr11、Chr15染色体上,标记距离为0~4.9 cM,贡献率为18.0%~85.5%.其中,检测到控制果锈的Qru-9、Qru-15、Qru-3的贡献率较高,可能是控制苹果果锈的关键位点.构建了苹果SLAF遗传图谱,获得了9个与果锈相关的QTL,研究结果对于苹果果锈及其相关基因的进一步挖掘与利用具有重要意义.