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du1新等位变异的克隆及其分子标记的开发

文献类型: 中文期刊

作者: 史亚兴 1 ; 刘俊玲 1 ; 朱贵川 1 ; 赫忠友 2 ; 刘辉 1 ; 樊艳丽 1 ; 徐丽 1 ; 卢柏山 1 ; 赵久然 1 ; 骆美洁 1 ;

作者机构: 1.北京市农林科学院玉米研究中心/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室

2.海南绿川种苗有限公司

关键词: 玉米;du1新等位变异;BSR-seq;反转座子插入;KASP分子标记

期刊名称: 作物杂志

ISSN: 1001-7283

年卷期: 2025 年 004 期

页码: 41-48

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 爽甜糯玉米是一种玉米新种质,其胚乳特性由糯基因和甜质基因共同控制,但甜质基因尚未被定位和克隆。本试验结果表明,爽甜糯(XT)玉米的自然晾干籽粒可溶性糖含量为62.82 mg/g,显著高于普通玉米的19.32 mg/g,但低于普甜(su1)玉米的110.9 mg/g。利用BSR-seq技术及基于籽粒皱缩特征将XT玉米中甜质基因定位到10号染色体24~68 Mb区间。比较XT玉米与普通玉米B73中候选基因Du1的全长DNA序列,发现XT玉米中du1基因在第3外显子的1455 bp位置后有5839 bp的Gypsy类LTR反转座子插入。cDNA序列分析发现,XT玉米中du1基因的转座子插入序列被大片段转录,导致转录本异常,故确定为甜质调控关键基因。该基因是du1突变体的一个新等位变异,针对基因突变位点开发的KASP分子标记能够高效区分du1du1、du1Du1和Du1Du1 3种基因型。

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