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巴西蕉AP2/ERF超家族全基因组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 侯晓婉 1 ; 胡伟 2 ; 徐碧玉 2 ; 金志强 3 ; 张鲁斌 4 ;

作者机构: 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

3.中国热带农业科学院海口实验站

4.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所海南省热带园艺产品采后生理与保鲜重点实验室

关键词: 香蕉;AP2/ERF;全基因组分析

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2017 年 38 卷 02 期

页码: 302-312

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 香蕉作为热带和亚热带发展中国家最重要的粮食和经济作物,其产量和质量受到低温、干旱、高盐等非生物逆境胁迫的严重影响。基于香蕉A基因组测序数据,利用生物信息学技术和方法,对巴西蕉中调控植物非生物逆境胁迫应答方面发挥重要作用的AP2/ERF超家族基因全基因组进行系统分析。结果表明:共获得119个巴西蕉AP2/ERF超家族基因,并将其划分成ERF(100)、RAV(15)和soloist(4)家族,其中ERF家族又被划分为10个亚家族,每个亚家族基因具有相似的保守motif和基因结构。此研究结果不仅为巴西蕉应答非生物逆境胁迫下AP2/ERF超家族基因功能和响应机制的研究、香蕉品种抗逆改良奠定理论基础,而且也为不同物种的AP2/ERF超家族基因的系统发育和进化研究提供方法和理论依据。

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