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北京地区百合无症病毒CP基因的克隆与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王贤 1 ; 田保华 1 ; 王永勤 1 ; 熊敏 1 ; 卫尊征 1 ; 王月华 2 ;

作者机构: 1.北京市农林科学院蔬菜研究中心

2.河北省廊坊市园林局

关键词: 百合;无症病毒;RT-PCR;克隆;分析

期刊名称: 中国植保导刊

ISSN: 1672-6820

年卷期: 2011 年 31 卷 05 期

页码: 5-8

收录情况: 北大核心

摘要: 以感染百合无症病毒(LSV)的百合叶片为材料,提取总RNA为模板,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增出856bp大小的LSV CP基因片段。经Blast比对发现,该基因片段与Genbank上发表的LSV CP基因序列(DQ294655.1)同源性为97.31%。由该序列推导出的氨基酸序列与其相似度为98.6%,仅存在某些氨基酸的差异。经过聚类分析表明,该CP基因的氨基酸序列与厦门和兰州分离的病毒遗传距离较近,而与海宁和广州分离的病毒遗传距离较远。

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