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五指山猪线粒体控制区序列分析及遗传多样性研究

文献类型： 中文期刊

作者： 于萍 1 ; 曹婷 2 ; 施力光 2 ; 刘雅芳 1 ; 赵春萍 1 ; 张立岭 1 ; 侯冠彧 2 ;

作者机构： 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 五指山猪;线粒体控制区;遗传多样性

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2015 年 42 卷 05 期

页码： 1222-1231

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究五指山猪遗传多样性和系统地位,本研究采用PCR产物直接测序法得到55条五指山猪线粒体控制区(mtDNA D-Loop)全序列,并结合GenBank中发表的1条五指山猪mtDNA D-Loop全序列进行结构分析、遗传多样性研究及系统发育分析。结果发现,56条序列中出现21次保守区变异,即"TTATAAAACAC"序列重复,共定义13个单倍型,发现14个变异位点,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.838和0.00334,表明五指山猪遗传多样性较丰富。五指山猪线粒体控制区序列构建的系统发育树和Network网络分析呈现两大分支,推测有两个母系起源,且与GenBank中其他23个猪种的聚类结果表明,五指山猪与长江流域以南地区的猪种有着较近的亲缘关系。

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