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巴西橡胶树钙调蛋白基因的克隆和表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 肖小虎 1 ; 隋金蕾 1 ; 戚继艳 1 ; 阳江华 1 ; 秦云霞 1 ; 唐朝荣 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所

关键词： 巴西橡胶树;钙调蛋白;基因克隆;基因家族;表达分析

期刊名称： 热带农业科学

ISSN： 1009-2196

年卷期： 2016 年 36 卷 07 期

页码： 37-41+48

摘要： 以拟南芥和杨树的钙调蛋白氨基酸序列为探针,对橡胶树转录组数据库进行搜索,并设计引物进行PCR扩增,得到7个橡胶树钙调蛋白基因的c DNA序列,命名为Hb Ca M1-7。序列分析结果发现,Hb Ca M1-7的CDS序列均为450 bp,编码149个氨基酸,分子量为16.8 ku,等电点为3.95。其中,Hb Ca M1-6间氨基酸同源性为100%,Hb Ca M7与其他成员之间的氨基酸同源性为98%。在基因结构组织方面,Hb Ca M1-7均为一个内含子,且内含子的插入位置相同,但内含子的长度明显不同。从氨基酸序列同源性和进化关系分析结果可看出,钙调蛋白基因家族在进化上非常保守。在表达方面,Hb Ca M1-6在各组织中均有表达,除了Hb Ca M3在根中表达丰度相对较高,其他成员均在胶乳中表达丰度相对较高,而Hb Ca M7在各组织中的表达均比较低;乙烯利处理后,Hb Ca M2-7的表达均有一定的上升趋势,而在叶片发育过程中Hb Ca M1-5碷呈明显下调表达。由此可见,橡胶树钙调蛋白与橡胶树叶片发育、胶乳乙烯信号通路具有一定的相关性。

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