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中国南瓜内参基因18S rRNA的克隆及其引物开发

文献类型: 中文期刊

作者: 朱海生 1 ; 王彬 1 ; 陈敏氡 1 ; 李永平 1 ; 张前荣 1 ; 刘建汀 1 ; 李大忠 1 ; 吴卫东 2 ; 温庆放 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院作物研究所

2.福建省种植业技术推广总站

关键词: 中国南瓜;18S rRNA;内参基因;实时荧光定量PCR

期刊名称: 西北农林科技大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-9387

年卷期: 2017 年 03 期

页码: 118-125

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】克隆获得中国南瓜18SrRNA,并设计合适的荧光定量PCR内参,为开展中国南瓜重要功能基因的表达模式和调控机制研究奠定基础。【方法】以中国南瓜‘密本’品种的基因组DNA为模板,通过PCR方法克隆中国南瓜18SrRNA基因序列,再利用Primer Premier软件设计荧光定量PCR引物,对该内参基因在中国南瓜不同组织、生长阶段及非生物胁迫条件下的表达稳定性进行检测。【结果】首次克隆得到中国南瓜18SrRNA基因序列,其长度为1 857bp,GenBank登录号为KM979454,该基因与西瓜、西葫芦等瓜类蔬菜18SrRNA基因同源性大都在90%以上;以中国南瓜内参基因18SrRNA核苷酸全长序列为基础设计1对荧光定量PCR引物,以中国南瓜果肉总RNA逆转录的cDNA第一链为模板进行PCR扩增,该引物扩增的片段大小为132bp,扩增效率高,特异性强;18SrRNA基因在中国南瓜不同组织、生长发育阶段及非生物胁迫条件下均能稳定表达。【结论】克隆获得中国南瓜18SrRNA基因,该基因适合在中国南瓜基因表达研究中作为内参基因。

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