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玉米泛素活化酶基因家族鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵秋芳 1 ; 贾利强 2 ; 马海洋 2 ; 陈曙 2 ; 陈宏良 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室

2.;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室

3.;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室;

关键词： 玉米;泛素活化酶;生物信息学;基因表达

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 8-14+19

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过生物信息学分析,从B73玉米全基因组中鉴定出4个泛素活化酶基因,分别命名为Zm UBA1~Zm UBA4。4个Zm UBA基因编码氨基酸数目在1 030~1 056 aa,编码蛋白分子量在114.63~117.39 k D,等电点在5.18~5.80,且均含有5个内含子。蛋白二级结构预测,4个基因编码的蛋白主要以α–螺旋和不规则卷曲为主,亚细胞定位预测4个基因均定位于细胞核中。荧光定量PCR结果表明,Zm UBA1基因在根、茎、叶、雄穗和雌穗中呈现组成性表达,Zm UBA2和Zm UBA4基因在雄穗表达量最高,Zm UBA3在叶片表达量最高,呈现组织特异性表达。Zm UBA3在盐和低温胁迫上调表达,Zm UBA4在盐胁迫时下调表达,说明Zm UBA3基因可能参与玉米低温和盐胁迫的应答,Zm UBA4可能参与玉米盐胁迫应答。

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