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铁皮石斛DoUGT83A1基因克隆及表达特性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张逸群 1 ; 陈家栋 2 ; 宋敏全 3 ; 姜武 2 ; 刘莹莹 2 ; 段晓婧 2 ; 陶正明 2 ;

作者机构: 1.浙江农林大学食品与健康学院浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室

2.浙江省亚热带作物研究所

3.浙江铁枫堂生物科技股份有限公司

关键词: 铁皮石斛;DoUGT83A1基因;生物信息学分析;表达特性分析;qRT-PCR

期刊名称: 中草药

ISSN: 0253-2670

年卷期: 2025 年 56 卷 001 期

页码: 259-268

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的 对铁皮石斛Dendrobium officinale中糖基转移酶基因DoUGT83A1进行克隆,并对其进行生物信息学及表达模式分析。方法 从铁皮石斛“雁荡山1号”叶组织中获得DoUGT83A1基因,利用软件进行生物信息学分析,利用MEGA11构建系统发育树,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测基因表达模式。结果 通过PCR扩增得到1个DoUGT83A1基因(GI:1622023669),该基因的CDS序列为1 347 bp,编码448个氨基酸。DoUGT83A1蛋白相对分子质量为54 330,理论等电点为5.75,为亲水性不稳定蛋白,无信号肽和跨膜区域,含有41个磷酸化位点,具有UDPGT和PSPG 2个保守结构域。氨基酸序列分析表明DoUGT83A1蛋白与金钗石斛Dendrobium nobile的UGT83A1蛋白的同源性最高,相似度为96.36%。分子对接结果证明DoUGT83A1蛋白对山柰酚具有较好的催化活性。组织特异性表达分析结果显示,DoUGT83A1在“雁荡山1号”不同组织相对表达量为:叶>茎>花>根(白根、绿根尖)。顺式作用元件分析结果表明,DoUGT83A1基因启动子序列含有多个与非生物胁迫响应相关的元件,且在低温、缺磷和菌根共生诱导下显著上调表达,推测该基因可能参与调控铁皮石斛菌根共生及非生物胁迫响应过程。结论 成功克隆获得铁皮石斛DoUGT83A1基因,并进行生物信息学分析和基因表达模式分析。为进一步探究DoUGT83A1基因功能及其在菌根共生和非生物胁迫响应中的作用机制提供理论依据。

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