文献类型： 中文期刊
作者： 张杰伟 1 ; 丁莉萍 1 ; 陈亚娟 1 ; 王宏芝 1 ; 魏建华 1 ;
作者机构： 1.北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心
关键词： 磷酸肌醇特异性磷脂酶C;杨树;进化分析;基因家族
期刊名称： 福建农业学报
ISSN： 1008-0384
年卷期： 2016 年 33 卷 11 期
页码： 1181-1186
收录情况： 北大核心
摘要： 为了对已测序杨树Populus trichocarpa Torr.&Gray中磷酸肌醇特异性磷脂酶C(phosphoinositidespecific phospholipase C,PI-PLC)家族基因进行系统分析,利用杨树基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定杨树PI-PLC家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过蛋白序列比对进行进化和分类分析。结果表明,杨树中含有7个PI-PLC家族基因,含有8~10个外显子,分布于杨树的4条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,杨树PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域。蛋白质进化树分析结果表明PI-PLC可分为2个亚家族。
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