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野生种花生钙依赖蛋白激酶基因家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 石鹏 1 ; 贺梁琼 2 ; 杨伟波 1 ; 符海泉 1 ; 徐中亮 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所

2.广西农业科学院经济作物研究所

关键词： 野生种花生;钙依赖蛋白激酶;生物信息学;EF手型结构域

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2017 年 38 卷 01 期

页码： 94-103

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Ca2+是植物中重要的第二信使,几乎介导了植物生长发育的全部反应。钙依赖蛋白激酶(CDPKs)是植物中重要的钙传感蛋白,在植物生命活动中扮演着重要角色。目前2个二倍体野生种花生全基因组序列已经公布,而由2个野生种杂交后形成的异源四倍体栽培种花生的全基因组序列还没有公布,野生种花生CDPKs的生物信息学分析结果可以为栽培种花生CDPKs的研究提供参考。本研究采用生物信息学方法和工具对2个野生种花生CDPKs基因家族的全基因组分布、基因结构、进化和理化性质等进行分析。结果表明:2个野生种花生全基因组均比对到35个CDPKs基因序列,野生种花生与拟南芥CDPKs基因结构类似,蛋白质结构具有典型的蛋白质激酶和EF手型结构域,2个野生种花生与其它物种在进化过程中CDPKs变异较小,可能作为钙传感蛋白在细胞内各个部位和细胞器中行使功能。本研究结果可为栽培种花生的CDPKs结构和功能研究提供参考。

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