文献类型： 中文期刊
作者： 向琳 1 ; 曾军 1 ; 王昊 1 ; 李薇 1 ; 董文化 1 ; 戴好富 1 ; 梅文莉 1 ;
作者机构： 1.华中农业大学植物科学技术学院;中国热带农业科学院热带生物技术研究所海南省沉香工程技术研究中心海口市热带天然产物研究与利用重点实验室;海南热带农业资源研究院海南省热带农业生物资源保护与利用重点实验室
关键词： 白木香;转录组;简单重复序列;序列特征;种质资源
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2024 年 22 卷 009 期
页码： 2971-2978
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为探究白木香的简单重复序列特征,开发SSR分子标记用于白木香种质资源的遗传分化和分子鉴定,本研究鉴定了白木香转录组unigene序列的SSR位点,对其SSR的分布及序列特征进行统计分析,进而设计SSR引物,并验证其SSR引物的多态性.结果表明,在128 712条unigene中共鉴定到9 362个SSR位点,分布频率为7.27%.SSR序列中双碱基重复序列最多,占总SSR的54.90%;白木香双碱基重复序列以AG/CT、AC/GT为主,占34.22%.SSR位点重复次数主要集中在5~11次,占总SSR位点数的96.56%,其中三碱基重复5次的SSR位点数最多,共有1 925个.设计并合成50对引物,其中35对引物可扩增出预期大小条带,扩增效率达到70%.以24个不同白木香个体对35对引物进行扩增,采用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测SSR引物多态性,表明SSR引物具有多态性.研究表明,白木香转录组SSR重复基元类型丰富,分布密度高,多态性高,可用于白木香资源的遗传多样性评价、遗传分化、种质鉴定和分子育种等后续研究.
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