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miR395abcd与其靶基因ATRX在不同耐寒木薯品种中对低温响应的差异性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 曾长英 1 ; 周玉飞 2 ; 彭明 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.海南大学农学院

关键词： mi R395abcd;靶基因;木薯;耐低温;差异表达分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2015 年 34 卷 11 期

页码： 2441-2447

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过实时定量PCR方法分析了mi R395abcd与其靶基因ATRX在两个木薯品种的4种低温处理下的差异表达情况,靶基因的定量引物设计在与mi RNA结合区的上游、结合边缘、结合区3个位置。结果显示mi R395abcd与其靶基因在两个木薯品种、4种低温处理和3个靶基因引物位置的表达量均不同,且mi R395abcd在C4和SC124两个品种间4种低温处理的6组两两比较中的相对表达量呈现完美的反向关系。进一步比较发现mi R395abcd与靶基因的负相关性在C4中最好,尤其是位于mi RNA与m RNA结合区上游的a引物的消长关系在AH(驯化后寒害:25~14℃驯化5 d后再降至4℃)和NAH(非驯化寒害:25℃直接降至4℃)中表现得最典型。具体而言,mi R395abcd在C4的AH和NAH处理中上调而在SC124的AH和NAH处理中下调表达,前期表型分析中AH和NAH处理下C4的低温胁迫症状小于SC124,预示着mi R395abcd的上调表达有利于木薯减轻低温伤害,其表达差异能够表征C4和SC124在耐低温性能的表型差异,且mi R395abcd对其靶基因ATRX的调控在木薯低温响应过程中起着正向保护作用。

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