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植物咖啡碱合成酶的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孔祥瑞 1 ; 杨军 1 ; 王让剑 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院茶叶研究所

关键词： 茶树;咖啡碱合成酶;生物信息学

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2014 年 V29 卷 12 期

页码： 1211-1218

摘要： 采用生物信息学分析方法对GenBank中来源于茶树、可可、山茶等植物咖啡碱合成酶的氨基酸序列进行比对分析,就等电点、亚细胞定位、信号肽、跨膜螺旋、保守性功能结构域及基序、二级结构与三级结构等重要参数进行预测与分析。结果表明,植物咖啡碱合成酶主要定位于胞质和胞核中,含有磷酸化、酰基化和糖基化修饰位点,基于基因序列与保守结构域可被分成3种类型,其中I型与II型酶蛋白均属全α型水溶性酶蛋白,III型酶蛋白除二级结构富含无规卷曲构件,还极有可能存在信号肽序列,但3类酶蛋白均无跨膜螺旋,三级结构预测显示,I型、II型酶蛋白极为相似,由α螺旋和横向β-折叠片层组成,III型则α螺旋位于横向两端,中间由纵向β-折叠片层连接。

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