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真菌类过氧化物酶体增殖因子PEX11基因家族生物信息学研究

文献类型: 中文期刊

作者: 张昕 1 ; 姜华 2 ; 王艳丽 2 ; 张震 2 ; 毛雪琴 2 ; 柴荣耀 2 ; 邱海萍 2 ; 杜新法 2 ; 王教瑜 2 ; 孙国昌 2 ;

作者机构: 1.杭州师范大学生命与环境科学学院

2.浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地

关键词: 真菌;过氧化物酶体;PEX11基因家族;生物信息学;进化分析

期刊名称: 遗传

ISSN: 0253-9772

年卷期: 2012 年 34 卷 05 期

页码: 635-646

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: PEX11基因家族成员是参与过氧化物酶体增殖调控的关键因子,文章利用生物信息学方法对26种代表性真菌的PEX11基因家族成员进行了检索和进化分析。研究发现:(1)26种真菌中共有66个可能的PEX11p。酵母类真菌有1个或2个PEX11p,而大多数丝状真菌中包含2到3个,其中子囊菌中PEX11p的个数偏多,个别种类达到5个;(2)真菌PEX11p可分为3类,大多数真菌含有类型Ⅰ和类型Ⅲ的PEX11p,类型Ⅱ是盘菌亚门真菌所特有的,可能与类型Ⅰ和类型Ⅱ在功能上有冗余;(3)通过MEME分析,发现PEX11p含有多个保守区域,其中C末端的Motif8具有很高的保守性,推测可能对PEX11p发挥功能具有重要作用。文章对进一步研究真菌PEX11p的进化与功能以及过氧化物酶体的增殖具有重要意义。

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