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核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘凯 1 ; 李瑶玲 2 ; 李洋 3 ; 王红霞 4 ; 赵书岗 2 ; 安秀红 4 ; 张志华 4 ;

作者机构: 1.河北农业大学园艺学院

2.河北农业大学生命科学学院

3.河北省农林科学院植物保护研究所

4.河北农业大学山区研究所/河北省农业工程中心/国家北方山区工程中心

关键词: 核桃;冷胁迫;COR413基因家族;表达分析

期刊名称: 河北农业大学学报

ISSN: 1000-1573

年卷期: 2022 年 002 期

页码: 14-20

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。

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