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高粱SSR和EST-SSR标记在割手密中的通用性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐磊 1 ; 邢淑莲 1 ; 姚艳丽 1 ; 胡小文 1 ; 刘洋 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院湛江实验站

关键词： 高粱;通用性;SSR;EST-SSR;割手密

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2015 年 31 卷 27 期

页码： 164-171

收录情况： CSCD

摘要： 目前,割手密中开发的分子标记有限,为增加其分子标记数量,本研究对高粱分子标记在割手密中的通用性进行分析。选用高粱的29对基因组SSR标记和20对EST-SSR标记在割手密种质GSM39中进行筛选,以评价其通用性。进一步利用14份割手密材料评价标记的多态性和遗传多样性。结果显示:70%的EST-SSR引物在割手密中得到成功扩增,可用的EST-SSR引物中多态性比率占50%。SSR引物在割手密中的通用性比率只有34.5%,但多态性比率为70%。14对多态性引物在14份割手密中共检测到33个等位基因,平均观测等位基因数为2.4286,平均有效等位基因数为1.7,平均观测表观杂合度为0.544,平均期望杂合度为0.3858,Nei’s基因多样性指数平均值为0.3716。结果表明,EST-SSR引物的通用性高于SSR引物,但SSR引物的多态性更高。这对割手密遗传多样性研究和比较基因组学研究具有重要意义。

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