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蓖麻WRKY转录因子的全基因组鉴定及其进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邹智 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所

关键词： 蓖麻;全基因组;WRKY转录因子;进化分析

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2013 年 35 卷 01 期

页码： 36-42

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨WRKY转录因子在蓖麻耐胁迫中可能的生物学功能,研究基于已公布的基因组和EST数据对蓖麻WRKY转录因子家族进行全面鉴定和系统命名,并在此基础上分析了其基因结构和进化特征。结果显示,蓖麻基因组中至少存在56个WRKY基因,它们散布于39条scaffolds上,所含内含子数目在1～5个;RcWRKYs包含1～2个WRKY结构域,根据WRKY结构域的数量及其锌指结构的特征,这些蛋白可分为I、IIa、IIb、IIc、IId、IIe和III类/亚类。与拟南芥相比,蓖麻的WRKY基因在物种分化后并未明显进化,它们中的大部分在拟南芥中都有同源基因;相对而言,在不同类基因中,I类的WRKY基因得到了较快的进化。

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