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巴西橡胶树HbRD22基因的电子克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 高静中国热带农业科学院科技信息研究所 1 ; 程汉 1 ; 蔡海滨 1 ; 安泽伟 1 ; 黄华孙 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心

关键词： 巴西橡胶树;HbRD22基因;电子克隆;生物信息学

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2010 年 31 卷 09 期

页码： 1439-1445

收录情况： CSCD

摘要： 利用电子克隆技术从低温诱导的巴西橡胶树全长cDNA文库中获得了HbRD22基因,该基因全长1 458 bp。生物信息学分析结果表明,HbRD22编码一个由338个氨基酸组成的、相对分子量为36.96 ku、等电点为7.65的多肽,并含有一个由217个氨基酸组成的BURP结构域。其推导的氨基酸序列与葡萄的同源性最高,达69%。信号肽预测结果表明HbRD22蛋白为分泌型蛋白,前21个氨基酸区域为信号肽区域。Northern blotting分析结果表明,该基因在正常生长情况下,表达水平较高,干旱胁迫后24 h,表达量逐渐减低,直至检测不到,揭示该基因受干旱胁迫负调控。

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