文献类型： 中文期刊
作者： 梁靖雯 1 ; 王鹏 2 ; 叶秀旭 2 ; 盖江涛 2 ; 白蓓蓓 1 ; 李倩 2 ; 刘咲頔 1 ; 徐诗涛 1 ;
作者机构： 1.海南大学热带农林学院
2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室
关键词： 蕨类植物;质子焦磷酸酶;结构域;进化关系
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2020 年 007 期
页码： 3168-3172
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了全面鉴定蕨类植物中质子焦磷酸酶(AVP1)编码基因,并构建家族进化关系,本研究首先通过检索PfamA数据库从AVP1蛋白序列中鉴定到了一个保守结构域,在此基础上,结合HMMER和BLAST,从6个物种基因组中鉴定到了18条质子焦磷酸酶家族基因.进化树构建结果表明,在勺叶槐叶萍中没有鉴定到AVP亚家族成员;而在细叶满江红中没有鉴定到AVPL亚家族成员.本研究为今后针对蕨类植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶标.
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