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甘蔗14-3-3基因克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 罗炼芳 1 ; 孔冉 1 ; 苏俊波 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

关键词： 甘蔗;14-3-3基因;聚类分析;蛋白结构;表达;实时定量PCR

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2013 年 44 卷 11 期

页码： 1757-1764

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】克隆甘蔗14-3-3基因并预测分析其编码蛋白的结构,为研究甘蔗基因功能和代谢调控机制提供参考。【方法】以水稻14-3-3基因为模板,BLAST甘蔗EST数据库,依据序列拼接结果及RT-PCR技术获得编码甘蔗14-3-3蛋白的全长基因,并用生物信息学方法对该蛋白的二级、高级结构和功能活性位点进行预测。【结果】克隆得到长784bp的甘蔗14-3-3基因,最大开放阅读框为771 bp,编码256个氨基酸;该蛋白的分子量与理论等电点分别为28.88 kDa和4.79。蛋白聚类分析结果表明,甘蔗14-3-3蛋白与水稻、高粱、玉米14-3-3蛋白的同源性均在90%以上。Cn3D V.4.1预测位于第3和第5两个二聚体上的Lys-50、Arg-57、Arg-131和Try-132组成一个凹穴,是结合靶蛋白的作用面;第60、65、188、218位的4个丝氨酸是磷酸化的活性位点。实时定量PCR检测结果表明,14-3-3基因在甘蔗不同组织中均有表达,在茎和分生组织中14-3-3基因高丰度表达,可能与糖代谢和细胞分裂的调控相关;而在根中可能参与矿物元素的吸收和代谢。【结论】甘蔗14-3-3基因可作为信号转导调控蛋白的候选基因之一。

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