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30份工业大麻种质资源的遗传多样性分析及指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

作者： 陈珊宇 1 ; 孟思洁 1 ; 田燕 1 ; 倪海滨 1 ; 阮关海 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所;浙江省农业科学院,浙江省数字旱粮重点实验室

关键词： 工业大麻;重测序;基因组;SNP变异;指纹图谱

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 21 卷 024 期

页码： 8151-8162

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 大麻是一种重要的经济作物,不仅可以用作纤维制品,还具有巨大的药用价值,但大麻的品种评价和鉴定工作还未系统开展.本研究通过对30个地方或栽培品种的全基因组进行重测,并开展系统发育、遗传变异、群体结构及指纹图谱构建等分析.结果显示,共获得38 963 175个SNP位点和3 629 262个Indel位点,其中SNP变异在全基因组上均匀分布.主成分分析中,栽培品种聚类PC1和PC2左下角,相比地方中品系散落在坐标系不同的位置,说明栽培品种的遗传基础相对接近.此外,栽培品种衰减速度更慢,栽培品系经历了强烈的人工选择.进一步发现,工业大麻的10条染色体上约有3.56%的位点存在受到人工选择的可能,并在5号染色体鉴定出一个显著分化的位点,此位点受到了强烈的人工选择.根据SNP标记的多样性、杂合度及连锁不平衡等指标,筛选出1 008个独立SNP,其等位基因频率在0.2~0.5之间,这些SNP标记在染色体上的分布相对均匀,且遗传频率适中,能够很好代表整个工业大麻基因组的变异,表明这些SNP适宜绘制了工业大麻品种特异指纹图谱.本研究结果对品种的高效鉴定和保护具有重要意义.

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