文献类型: 中文期刊
作者: 徐磊 1 ; 姚艳丽 1 ; 胡小文 1 ; 邢淑莲 1 ; 刘洋 1 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院湛江实验站
关键词: 甘蔗;SoGST-1a基因;RT-PCR;实时荧光定量PCR
期刊名称: 中国农学通报
ISSN: 1000-6850
年卷期: 2015 年 31 卷 26 期
页码: 71-77
收录情况: CSCD
摘要: 克隆甘蔗谷胱甘肽硫转移酶(Glutathione S-transferase,GST)基因,并分析其序列特征和表达谱,为甘蔗抗旱育种提供基因来源。本研究采用电子克隆和RT-PCR技术从甘蔗品种‘新台糖22号’中克隆到一个甘蔗GST基因,命名为SoGST-1a。通过生物信息学软件分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR检测其表达谱。序列分析表明该基因cDNA全长702 bp,编码224个氨基酸,预测的蛋白分子式为C1117H1750N300O328S6,蛋白分子量为24.82 k Da,等电点为5.96。蛋白疏水性分析推测其为亲水性蛋白。保守结构域预测表明SoGST-1a蛋白具有2个GST结构域。系统进化树分析表明该基因与玉米Zeta类GST蛋白亲缘关系最近。荧光定量PCR分析显示,干旱胁迫下SoGST-1a基因下调表达。研究结果表明,SoGST-1a基因可能在甘蔗干旱胁迫中并不发挥一定作用。这些结果为深入了解SoGST-1a基因的生物学功能奠定了基础。
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