文献类型： 中文期刊

作者： 刘华波 ¹ ; 熊融 ¹ ; 倪杨 ¹ ; 魏灵芝 ¹ ; 孙健 ¹ ; 王桂霞 ¹ ; 张运涛 ¹ ; 高用顺 ¹ ;

作者机构： 1.北京市农林科学院林业果树研究所

关键词： 草莓属;叶绿体基因组;密码子偏好性;系统发育

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 012 期

页码： 4064-4073

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用生物信息学手段分析20个草莓属植物叶绿体基因组的密码子使用模式，为深入解析草莓属植物的进化规律奠定基础。结果显示，20个草莓属植物叶绿体基因组的GC含量为36.06%～37.62%之间，密码子第三位碱基平均GC含量在30.23%～30.46%之间，平均有效密码子数为48.12～48.43，不同草莓属植物叶绿体基因组表现为相似的密码子使用模式；共鉴定出30个高频密码子和12个最优密码子；中性绘图分析、ENC-plot分析、PR2-plot分析表明自然选择是草莓属植物密码子偏性形成的主要因素；基于RSCU的聚类结果表明，密码子使用模式相近的物种表现为进化上的相关。