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蜡状芽胞杆菌群三大类全基因组序列的同源性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭刚 1 ; 马琪奇 2 ; 李炫 3 ; 曾会才 1 ; 刘正初 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院海口实验站/香蕉研究所

2.华中农业大学生命科学技术学院

3.中国农业科学院麻类研究所

关键词： 蜡状芽胞杆菌群;全基因组;基因组装配

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2010 年 29 卷 05 期

页码： 186-190

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 全基因组比对一般采用全基因组范围内的序列比对,本文首次采用单基因在全基因组范围内进行基因排列比对,选取了蜡状芽胞杆菌群中的44个必须基因,在该群中3大类共5个(Bt.97-27,Bc.14579,Bc.10987,Bc.E33L和Ba.Ames Ancestor)全基因组进行横向比对,所有基因在各个基因组中的排列顺序完全一致,少有交叉,进一步证明:在蜡状芽胞杆菌群中,特别是在蜡状芽胞杆菌、苏云金芽胞杆菌和炭疽芽胞杆菌之间,存在相当大的基因相似性,这与前人的研究结果一致。这种相似性有利于将来用于在该群中所有菌株的全基因组测序装配中。

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