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水稻种子发育期间特异锌指蛋白基因的筛选与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周淑芬 1 ; 刘华清 1 ; 徐桂磊 1 ; 颜静宛 1 ; 王锋 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院生物技术研究所福建省农业遗传工程重点实验室

关键词: 水稻;锌指蛋白基因;种子特异表达;RT-PCR

期刊名称: 中国生物化学与分子生物学报

ISSN: 1007-7626

年卷期: 2012 年 28 卷 11 期

页码: 1033-1039

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 锌指蛋白基因是植物基因组中最大最复杂的基因家族之一.大部分的锌指模体存在于转录因子中,它们在转录水平上参与植物生长发育及植物对生物和非生物胁迫的反应.为了解锌指蛋白基因在水稻种子发育中的作用,本研究通过多种数据库搜索获得了878个水稻锌指蛋白基因.从中选取311个利用RT-PCR技术分析它们在水稻成熟期根、茎、叶、花及不同发育阶段种子中的表达特征.结果发现,共有196个基因能在至少1个水稻器官中表达,其中10个为种子特异性表达基因.进一步分析发现,10个特异表达基因在水稻种子不同发育阶段中的表达具有种子阶段表达特异性.同时分析它们的基因及蛋白结构特点,结果显示它们的结构较简单,其中3个蛋白含有线粒体靶肽,5个蛋白含有CCCH锌指结构域.另外,分析种子特异性表达基因上游调控区的顺式作用元件,结果表明它们都含有TATA-box、CAAT-box和种子特异调控元件,除此之外还发现了光、激素和胁迫反应相关调控元件.这些结果为进一步研究它们在种子发育过程中的生物学功能提供了有用的线索.

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