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香蕉AP2/ERFs超家族的重新鉴定及在果实采后成熟过程中的差异表达特性

文献类型: 中文期刊

作者: 张海波 1 ; 郑云柯 2 ; 付毛妮 3 ; 张建斌 2 ; 贾彩红 3 ; 李新国 1 ; 刘菊华 2 ;

作者机构: 1.海南大学热带农林学院

2.中国热带农业科学院三亚研究院

3.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词: 香蕉;AP2/ERFs;全基因组分析;果实成熟;差异表达分析

期刊名称: 果树学报

ISSN: 1009-9980

年卷期: 2024 年 005 期

页码: 861-874

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】在全基因组水平上重新鉴定香蕉A基因组中的AP2/ERF家族成员,研究其在香蕉果实采后成熟过程中的差异表达特性,明确可能参与香蕉果实成熟调控的关键基因。【方法】对香蕉A基因组中AP2/ERF家族成员进行系统进化、结构特征、蛋白质特性、保守结构域分析和两大类主栽品种巴西蕉(AAA)和粉蕉(ABB)果实采后成熟不同阶段的转录组分析。【结果】发现AP2/ERFs家族共有317个家族成员,分为AP2(49个)、ERF(253)和RAV(15)三个亚家族,他们不均匀地分布在染色体上。根据保守结构域和基因结构特征,ERF又分为a、b、c、d、e、f、h、i、j和k共10个亚类。转录组分析结果表明,在巴西蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有77个,其中高水平表达的有MaERF15、36、42和AP2-28。在粉蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有74个,其中高水平表达的有MaERF42和AP2-28。同时在巴西蕉和粉蕉果实成熟过程中差异表达的基因有57个,其中高水平表达的基因有MaERF15、42和AP2-28,只在巴西蕉果实中特异表达的有20个,只在粉蕉中特异表达的有17个。【结论】重新鉴定了香蕉AP2/ERFs超家族成员及其在果实后熟过程中的差异表达特性,为系统深入解析香蕉AP2/ERF基因功能奠定了基础,对为调控香蕉果实成熟提供靶标基因具有一定的理论意义。

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