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番茄环纹斑点病毒(TZSV)实时荧光定量PCR检测方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 徐弢 1 ; 郑雪 2 ; 张晓林 2 ; 陈永对 2 ; 穆野 2 ; 陈勇 2 ; 郑宽瑜 2 ; 赵立华 2 ; 刘小烛 2 ; 张洁 3 ;

作者机构: 1.西南林业大学生命科学学院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室;福建省农业科学院植物保护研究所

2.;西南林业大学生命科学学院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室;福建省农业科学院植物保护研究所

3.;西南林业大学生命科学学院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室;福建省农业科学院植物保护研究所;

关键词: 番茄环纹斑点病毒;实时荧光定量PCR;检测方法

期刊名称: 山东农业科学

ISSN: 1001-4942

年卷期: 2017 年 07 期

页码: 139-144

摘要: 本研究根据番茄环纹斑点病毒(Tomato zonate spot virus,TZSV)保守N基因(Gen Bank登录号:13YV639)设计一对特异性引物,通过优化反应条件和反应体系,构建了TZSV的SYBR Green RT-qPCR检测方法。该方法稳定可靠,组内和组间的变异系数都小于2%;标准曲线的斜率和相关系数分别为-3.39和0.996,扩增效率为97.44%;最低能检测到1.07×10~4copies/μL的阳性质粒,灵敏度为常规PCR的1 000倍。同时利用构建的RT-qPCR方法检测TSWV、TNSa V、PCSV和TZSV四种病毒,只有TZSV有特异扩增曲线,表明该方法特异性良好。本研究构建的RT-qPCR方法能够为TZSV的早期预警与动态监测提供可靠的技术支撑。

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