文献类型： 中文期刊
作者： 葛佳 1 ; 谢华 1 ; 崔崇士 2 ; 洪剑明 3 ; 马荣才 1 ;
作者机构： 1.北京农业生物技术研究中心
2.东北农业大学园艺学院
3.首都师范大学生命科学学院
关键词： EST;EST-SSR;大白菜
期刊名称： 农业生物技术学报
ISSN： 1006-1304
年卷期： 2005 年 13 卷 04 期
页码： 423-428
收录情况： CSCD
摘要： 对大白菜(BrassicacampestrisL.ssppekinensis)13007个EST序列进行拼接共得到7714个片段重叠群(contig),其中10.4%(890个)非冗余EST含有SSR标记(EST-SSR),标记间平均间隔距离为3.9kb,单、双和三核苷酸重复序列大约各占1/3左右。CDS所包含的三核苷酸重复序列最多,而且AAG/CTT重复序列的含量最高。通过同源性比较分析,获得功能已知的SSR-ESTs774个,共计含有846个SSR,其中50.2%位于5'-UTR,31.4%位于3'-UTR,18.4%位于CDS。实验选取123个SSR座位设计引物,利用芜菁花叶病毒(Turnipmosaicvirus,TuMV)的高抗和高感大白菜F6代自交系材料各2份,分析EST-SSR标记多态性。结果表明,其中37个标记可进行有效扩增,但是没有表现出多态性,23个标记(18.7%)至少在1份材料中具有多态性。对这些EST-SSR标记在大白菜和其它芸薹属植物的系统发育关系分析、遗传作图和基因定位的应用进行了讨论。
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