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鸭腺病毒3型Hexon基因的克隆及SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 陈翠腾 1 ; 万春和 1 ; 程龙飞 1 ; 傅光华 1 ; 施少华 1 ; 刘荣昌 1 ; 陈珍 1 ; 朱春华 1 ; 黄瑜 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心/福建省禽病防治重点实验室

关键词: 鸭腺病毒3型;Hexon基因;SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法

期刊名称: 中国兽医学报

ISSN: 1005-4545

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 1104-1112

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 鸭腺病毒3型(duck adenovirus type 3,DAdV-3)是近年来我国新发鸭源禽腺病毒。本试验根据NCBI数据库中DAdV-3 Hexon基因特征,设计特异性引物,获得番鸭源DAdV-3福建株(命名为W1FJ株)Hexon基因全长,明确其分子特征,并基于此建立检测DAdV-3的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。结果表明,克隆的W1FJ株Hexon基因全长为2 814 bp,编码937个氨基酸,和DAdV-3(CH-GD-12-2014株)核苷酸同源性为100%,但和鸭源禽腺病毒B型(也称鸭腺病毒2型,DAdV-2,GR株)核苷酸同源性仅为76.6%。Hexon蛋白遗传进化分析表明,W1FJ株和CH-GD-12-2014株在遗传进化上形成一个独立的分支,与鸭源禽腺病毒B型和鹅源禽腺病毒A型(goose aviadenovirus A)在遗传进化上明显不同,建议将其命名为鸭源禽腺病毒C型(duck aviadenovirus C)。建立的检测DAdV-3的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,灵敏度高,最低检测限为61拷贝/μL;特异性强,和鸭群常见传染病病原均无交叉反应,扩增产物的熔解曲线只出现1个特异性单峰,Tm值为(81.48±0.25)℃;重复性好,组内和组间重复试验变异系数分别为0.49%~1.64%和0.67%~2.40%。本试验为DAdV-3的科学分类和后续开展DAdV-3感染的流行病学调查及致病机理研究奠定基础。

  • 相关文献

[1]鸭腺病毒3型LAMP快速检测方法的建立. 陈翠腾,黄瑜,陈珍,朱春华,傅光华,程龙飞,刘荣昌,刘斌琼,万春和. 2022

[2]禽腺病毒DAdV-3和FAdV-4双重荧光定量PCR检测方法的建立及应用. 周珈羽,朱春华,陈珍,程龙飞,陈翠腾,傅光华,万春和,施少华,梁齐章,陈红梅,傅秋玲,刘荣昌,黄小红,黄瑜. 2024

[3]鸭腺病毒A型TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立. 万春和,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

[4]鸭腺病毒A型Hexon基因克隆与序列分析. 万春和,刘荣昌,陈翠腾,程龙飞,傅光华,傅秋玲,施少华,陈红梅,黄瑜. 2017

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